MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Dehalococcoides sp. GT chromosome

Total Repeats: 22210

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013890	AGC	2	6	277	282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289431956
2	NC_013890	ACG	2	6	357	362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289431956
3	NC_013890	A	6	6	438	443	100 %	0 %	0 %	0 %	289431956
4	NC_013890	TAC	2	6	454	459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289431956
5	NC_013890	GCT	2	6	512	517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289431956
6	NC_013890	ACAA	2	8	527	534	75 %	0 %	0 %	25 %	289431956
7	NC_013890	GCC	2	6	629	634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431956
8	NC_013890	CCG	2	6	736	741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431956
9	NC_013890	TCT	2	6	788	793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431956
10	NC_013890	GAA	2	6	812	817	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431956
11	NC_013890	GAT	2	6	857	862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431956
12	NC_013890	GAA	2	6	893	898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431956
13	NC_013890	CCCA	2	8	964	971	25 %	0 %	0 %	75 %	289431956
14	NC_013890	CCG	2	6	1040	1045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431956
15	NC_013890	A	6	6	1050	1055	100 %	0 %	0 %	0 %	289431956
16	NC_013890	GCC	2	6	1352	1357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431956
17	NC_013890	ACA	2	6	1408	1413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	289431956
18	NC_013890	CT	3	6	1423	1428	0 %	50 %	0 %	50 %	289431956
19	NC_013890	GAA	2	6	1455	1460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431956
20	NC_013890	AGCTGG	2	12	1497	1508	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	289431956
21	NC_013890	ACC	2	6	1551	1556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289431956
22	NC_013890	CGG	2	6	1949	1954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431957
23	NC_013890	CGG	2	6	1997	2002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431957
24	NC_013890	CGG	2	6	2018	2023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431957
25	NC_013890	CGG	2	6	2027	2032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431957
26	NC_013890	GGT	2	6	2118	2123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289431957
27	NC_013890	CTA	2	6	2191	2196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289431957
28	NC_013890	GGA	2	6	2201	2206	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289431957
29	NC_013890	AGGG	2	8	2278	2285	25 %	0 %	75 %	0 %	289431957
30	NC_013890	GCG	2	6	2353	2358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431957
31	NC_013890	TAT	2	6	2402	2407	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431957
32	NC_013890	CTG	2	6	2445	2450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289431957
33	NC_013890	TAC	2	6	2486	2491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289431957
34	NC_013890	CTG	2	6	2640	2645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289431957
35	NC_013890	GAT	2	6	2670	2675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431957
36	NC_013890	GGT	2	6	2735	2740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289431957
37	NC_013890	AGAT	2	8	2752	2759	50 %	25 %	25 %	0 %	289431957
38	NC_013890	GAA	2	6	2784	2789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431957
39	NC_013890	AAG	2	6	2806	2811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431957
40	NC_013890	T	6	6	2826	2831	0 %	100 %	0 %	0 %	289431957
41	NC_013890	CTG	2	6	2865	2870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289431957
42	NC_013890	GCG	2	6	2904	2909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431957
43	NC_013890	AT	3	6	2911	2916	50 %	50 %	0 %	0 %	289431957
44	NC_013890	TGGC	2	8	3002	3009	0 %	25 %	50 %	25 %	289431957
45	NC_013890	ATT	2	6	3036	3041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431957
46	NC_013890	AGG	2	6	3072	3077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289431957
47	NC_013890	G	6	6	3199	3204	0 %	0 %	100 %	0 %	289431958
48	NC_013890	A	6	6	3253	3258	100 %	0 %	0 %	0 %	289431958
49	NC_013890	GGCTGG	2	12	3261	3272	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	289431958
50	NC_013890	TAT	2	6	3305	3310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431958
51	NC_013890	AAG	2	6	3412	3417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431958
52	NC_013890	CTTTA	2	10	3482	3491	20 %	60 %	0 %	20 %	289431958
53	NC_013890	GCTGG	2	10	3493	3502	0 %	20 %	60 %	20 %	289431958
54	NC_013890	ATA	2	6	3545	3550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289431958
55	NC_013890	TGA	2	6	3613	3618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431958
56	NC_013890	CAG	2	6	3635	3640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289431958
57	NC_013890	AT	3	6	3672	3677	50 %	50 %	0 %	0 %	289431958
58	NC_013890	CTT	2	6	3678	3683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431958
59	NC_013890	CGG	2	6	3735	3740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431958
60	NC_013890	TAAA	2	8	3781	3788	75 %	25 %	0 %	0 %	289431958
61	NC_013890	CAG	2	6	3945	3950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289431959
62	NC_013890	GGC	2	6	3972	3977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431959
63	NC_013890	TCC	2	6	4028	4033	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289431959
64	NC_013890	CAT	2	6	4127	4132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289431959
65	NC_013890	AG	3	6	4172	4177	50 %	0 %	50 %	0 %	289431959
66	NC_013890	TAA	2	6	4208	4213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289431959
67	NC_013890	GAA	2	6	4230	4235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431959
68	NC_013890	TGA	2	6	4358	4363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431959
69	NC_013890	TTC	2	6	4374	4379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431959
70	NC_013890	GCG	2	6	4455	4460	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431959
71	NC_013890	ACC	2	6	4482	4487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289431959
72	NC_013890	CAGG	2	8	4559	4566	25 %	0 %	50 %	25 %	289431959
73	NC_013890	GCGG	2	8	4614	4621	0 %	0 %	75 %	25 %	289431959
74	NC_013890	GGC	2	6	4635	4640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431959
75	NC_013890	ATC	2	6	4671	4676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289431959
76	NC_013890	TTC	2	6	4683	4688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431959
77	NC_013890	ACGT	2	8	4824	4831	25 %	25 %	25 %	25 %	289431959
78	NC_013890	CCG	2	6	4936	4941	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431959
79	NC_013890	T	6	6	5034	5039	0 %	100 %	0 %	0 %	289431959
80	NC_013890	TA	3	6	5043	5048	50 %	50 %	0 %	0 %	289431959
81	NC_013890	ACC	2	6	5109	5114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289431959
82	NC_013890	TAA	2	6	5122	5127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	289431959
83	NC_013890	TCG	2	6	5149	5154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289431959
84	NC_013890	AT	3	6	5158	5163	50 %	50 %	0 %	0 %	289431959
85	NC_013890	TTG	2	6	5176	5181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	289431959
86	NC_013890	GTCA	2	8	5205	5212	25 %	25 %	25 %	25 %	289431959
87	NC_013890	GTG	2	6	5233	5238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289431959
88	NC_013890	GTG	2	6	5269	5274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289431959
89	NC_013890	CTT	2	6	5300	5305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431959
90	NC_013890	CCG	2	6	5428	5433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431959
91	NC_013890	GCC	2	6	5451	5456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431959
92	NC_013890	GTA	2	6	5512	5517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431959
93	NC_013890	TTA	2	6	6044	6049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431960
94	NC_013890	GTG	2	6	6127	6132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289431960
95	NC_013890	T	6	6	6176	6181	0 %	100 %	0 %	0 %	289431960
96	NC_013890	ACCC	2	8	6216	6223	25 %	0 %	0 %	75 %	289431960
97	NC_013890	TTC	2	6	6261	6266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431960
98	NC_013890	TC	3	6	6297	6302	0 %	50 %	0 %	50 %	289431960
99	NC_013890	TTC	2	6	6306	6311	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431960
100	NC_013890	TAT	2	6	6378	6383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431960
101	NC_013890	GCA	2	6	6405	6410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	289431960
102	NC_013890	AGGT	2	8	6467	6474	25 %	25 %	50 %	0 %	289431960
103	NC_013890	TGG	2	6	6476	6481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289431960
104	NC_013890	G	6	6	6489	6494	0 %	0 %	100 %	0 %	289431960
105	NC_013890	ACC	2	6	6499	6504	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289431960
106	NC_013890	CTG	2	6	6516	6521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	289431960
107	NC_013890	GAG	2	6	6525	6530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	289431960
108	NC_013890	TGA	2	6	6544	6549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	289431960
109	NC_013890	GTTC	2	8	6700	6707	0 %	50 %	25 %	25 %	289431960
110	NC_013890	CTT	2	6	6711	6716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431960
111	NC_013890	TCTT	2	8	6802	6809	0 %	75 %	0 %	25 %	289431960
112	NC_013890	GGT	2	6	6810	6815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	289431960
113	NC_013890	ACC	2	6	6826	6831	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289431960
114	NC_013890	T	6	6	6838	6843	0 %	100 %	0 %	0 %	289431960
115	NC_013890	AAAGAC	2	12	6981	6992	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	289431960
116	NC_013890	TTC	2	6	7032	7037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431960
117	NC_013890	TCT	2	6	7108	7113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431960
118	NC_013890	CGG	2	6	7118	7123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431960
119	NC_013890	GGC	2	6	7140	7145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431960
120	NC_013890	CGG	2	6	7223	7228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431960
121	NC_013890	GTTTG	2	10	7248	7257	0 %	60 %	40 %	0 %	289431960
122	NC_013890	ATC	2	6	7272	7277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	289431960
123	NC_013890	GGC	2	6	7451	7456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431960
124	NC_013890	T	7	7	7480	7486	0 %	100 %	0 %	0 %	289431960
125	NC_013890	AT	3	6	7662	7667	50 %	50 %	0 %	0 %	289431960
126	NC_013890	GCG	2	6	7692	7697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431960
127	NC_013890	CCA	2	6	7787	7792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	289431960
128	NC_013890	GCC	2	6	7833	7838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	289431960
129	NC_013890	TCT	2	6	7852	7857	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431960
130	NC_013890	T	6	6	7929	7934	0 %	100 %	0 %	0 %	289431960
131	NC_013890	GGC	2	6	8001	8006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431960
132	NC_013890	GCG	2	6	8098	8103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	289431960
133	NC_013890	CCT	2	6	8117	8122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	289431960
134	NC_013890	G	6	6	8143	8148	0 %	0 %	100 %	0 %	289431960
135	NC_013890	AGA	2	6	8340	8345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431961
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139	NC_013890	GCATG	2	10	8589	8598	20 %	20 %	40 %	20 %	289431961
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149	NC_013890	ATT	2	6	9241	9246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431961
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241	NC_013890	GGGGT	2	10	13770	13779	0 %	20 %	80 %	0 %	289431966
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249	NC_013890	ATTT	2	8	14537	14544	25 %	75 %	0 %	0 %	289431967
250	NC_013890	TCGGG	2	10	14626	14635	0 %	20 %	60 %	20 %	289431967
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254	NC_013890	GTGAA	2	10	15198	15207	40 %	20 %	40 %	0 %	289431968
255	NC_013890	AAG	2	6	15269	15274	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431968
256	NC_013890	ACTGGA	2	12	15280	15291	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	289431968
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258	NC_013890	GAA	2	6	15437	15442	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	289431968
259	NC_013890	CTGAA	2	10	15471	15480	40 %	20 %	20 %	20 %	289431968
260	NC_013890	TTC	2	6	15523	15528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	289431968
261	NC_013890	TCTA	2	8	15609	15616	25 %	50 %	0 %	25 %	289431969
262	NC_013890	TTA	2	6	15677	15682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	289431969
263	NC_013890	AG	3	6	15699	15704	50 %	0 %	50 %	0 %	289431969
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270	NC_013890	TA	3	6	16282	16287	50 %	50 %	0 %	0 %	289431969
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